Разрабатывают программное обеспечение для раскрытия происхождения онкологии

Может ли знание того, откуда произошли ваши предки, быть ключом к лучшему лечению рака? Может быть, но куда этот ключ подойдет? Как мы можем проследить наследственные корни рака до современных решений? По мнению профессора-исследователя Лаборатории Колд-Спринг-Харбор (CSHL) Александра Красница, ответы могут лежать глубоко в обширных базах данных и больничных архивах, содержащих сотни тысяч образцов опухолей. Красниц и научный сотрудник CSHL Паскаль Белло работают над выявлением генеалогической связи между раком и расой или этнической принадлежностью. Они разработали новое программное обеспечение , которое точно определяет континентальное происхождение по ДНК и РНК опухоли. Их последнее исследование опубликовано в журнале Cancer Research , и их работа может помочь клиницистам разработать новые стратегии раннего выявления рака и персонализированного лечения. «Почему люди разных рас и национальностей заболевают разными видами рака с разной скоростью? У них разные привычки, условия жизни, воздействия — все виды социальных и экологических факторов . Но может быть и генетический компонент». Команда Красница обучила свои программные инструменты, используя гибридные профили ДНК. Они создали эти профили из раковых и неродственных свободных от рака геномов известного происхождения. Затем они проверили работу программного обеспечения на образцах рака поджелудочной железы, яичников, молочной железы и крови у пациентов с известным происхождением. Команда обнаружила, что программное обеспечение сопоставило их гибридные профили с континентальным населением с точностью более 95%. «У нас есть хорошая модель, на которую можно опираться, — говорит Красниц. «Но очень немногие люди происходят от одного предка. Мы все в какой-то степени смешаны. Поэтому сейчас мы работаем над тем, чтобы заглянуть глубже, протестировать образцы опухолей неизвестного происхождения, выявить смешение предков и добиться большей региональной специфичности». Насколько конкретно? А пока представьте себе Западную Африку, а не Восточную Африку. Красниц и Белло недавно присоединились к исследованию колоректального рака в сотрудничестве с Northwell Health и SUNY Downstate Medical Center. Исследование позволяет им изучить, как колоректальный рак по- разному мутирует гены в зависимости от конкретной расы или этнической принадлежности. Они надеются еще больше усовершенствовать свое программное обеспечение, чтобы сделать вывод о происхождении не только целых геномов, но и каждой отдельной последовательности в них. «Если мы сможем идентифицировать более локализованные предки, которые восприимчивы к различным видам рака или другим агрессивным заболеваниям, это может помочь нам определить конкретную часть генома, ответственную за это, и нацелить ее на лечение», — говорит Белло. Прямо сейчас простой мазок ДНК может сказать вам, откуда вы родом и какие болезни вы можете унаследовать. В будущем это может дать вам возможность победить и их....

Сообщает android-robot.com

 

Опубликовано: 03:00, 31.12.2022

 

Новость из рубрики:

 

Поделиться новостью:

 

Топ новости часа

• Twitch: платформа для заработка на стриминге и доходах от рекламы...
• Зеленский ввел санкции против ФСБ, Совфеда и Минфина России...
• Сергей Шойгу озвучил главную задачу ВС России на 2023 год...
• Компания Samsung представила среднебюджетный смартфон Samsung Galaxy A14 5G...
• Что происходит после ввода войск России на Украину. День 334-й // Онлайн-трансляция: последние новости и заявления 23 января...
• Что можно сделать, пока готовит мультиварка...